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Le travail de découpage des masses d’eau de surface résulte du croisement de deux types de données cartographiques :
Une première délimitation avait été réalisée par le Cemagref à la demande du Ministère de l’Ecologie et du Développement Durable. La démarche reposait sur une approche descendante utilisant les déterminants primaires de fonctionnement des hydrosystèmes (géologie, relief, climat) pour la classification. En fonction de ces éléments, et pour rester cohérent avec le niveau de précision appliqué en métropole, deux hydro-écorégions de premier niveau (HER-1) ont été délimitées:
Les expertises de terrain ont permis d’affiner ce découpage (Carte ci-dessous). Celui-ci se cale sur le point de remontée de l’onde de marée en conditions normales, considérant que le fonctionnement hydro-biologique des cours d’eau est étroitement lié à ce facteur.

Les hydroécorégions du district de la Guyane
Le rang de Strahler peut être retenu comme indicateur de la position du tronçon dans la hiérarchie de l’hydrosystème et comme indicateur du gradient amont/aval. Cette classification présente une assez bonne robustesse vis-à-vis de la géométrie du réseau hydrographique tout en donnant une image proche de la réalité du point de vue hydromorphologique (variables hydrologiques, superficie de bassin versant, pente, largeur…).
Pour simplifier, le rang de Strahler (qui se traduit par un numéro d’ordre) traduit en quelque sorte la puissance hydraulique d’un tronçon de cours d’eau. Plus ce numéro d’ordre sera élevé, plus la puissance hydraulique du fleuve sera forte.
Le classement des cours d’eau de Guyane en rangs de Strahler est présenté ci-dessous.

Classement en rangs de Strahler des cours d’eau de Guyane
La délimitation des masses d’eau de surface a été effectuée par croisement des hydroécorégions avec les ordres de Strahler. Etant donné l’importance du réseau hydrographique du district, seuls les cours d’eau de rang de Strahler supérieur ou égal à 3 avaient été pris en compte dans un premier temps. Cependant, pour répondre à la demande du Ministère en charge de l’Environnement, un nouveau découpage intégrant les cours d’eau de rang 1 et 2 a été élaboré. Il est basé sur le regroupement des cours d’eau de rang 1 et 2 connexes dont le linéaire est au moins égal à 5 km. Pour les cours d’eau de rang 1 se jetant directement dans les cours d’eau de rang 3 ou supérieur, seuls ceux de longueur minimale 5 km on été conservés. Le croisement des hydro-écorégions (de premier niveau) et de l’ordination en rangs de Strahler a engendré la délimitation de 1279 masses d’eau de surface, dont 1278 masses d’eau cours d’eau et 1 masse d’eau plan d’eau. Ce nombre de masses d’eau étant trop élevé pour pouvoir en faire un suivi, il a été réduit en :
Ces critères permettent de conserver une couverture représentative des masses d’eau superficielle. La Figure ci-dessous présente la délimitation des masses d’eau de surface de Guyane.

Les différentes Masses d’eau de surface en Guyane
Au final, la Guyane se caractérise par 934 masses d’eau cours d’eau et une masse d’eau de type plan d’eau.